MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Rhodospirillum rubrum ATCC 11170 plasmid unnamed

Total Repeats: 1205

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007641	ACG	2	6	45	50	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007641	GAG	2	6	76	81	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007641	CTC	2	6	118	123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_007641	AT	3	6	175	180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007641	GGT	2	6	247	252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007641	ACC	2	6	296	301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83582731
7	NC_007641	TGC	2	6	348	353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83582731
8	NC_007641	CAG	2	6	464	469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83582731
9	NC_007641	ATC	2	6	503	508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83582731
10	NC_007641	G	6	6	515	520	0 %	0 %	100 %	0 %	83582731
11	NC_007641	GCG	2	6	605	610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83582731
12	NC_007641	GCC	2	6	621	626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83582731
13	NC_007641	CCGG	2	8	692	699	0 %	0 %	50 %	50 %	83582731
14	NC_007641	CGC	2	6	715	720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83582731
15	NC_007641	GCT	2	6	724	729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83582731
16	NC_007641	CGC	2	6	793	798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83582731
17	NC_007641	GGC	2	6	799	804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83582731
18	NC_007641	GCG	2	6	855	860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83582731
19	NC_007641	CCCT	2	8	1002	1009	0 %	25 %	0 %	75 %	83582732
20	NC_007641	TGGG	2	8	1033	1040	0 %	25 %	75 %	0 %	83582732
21	NC_007641	CG	3	6	1115	1120	0 %	0 %	50 %	50 %	83582732
22	NC_007641	GAG	2	6	1175	1180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83582732
23	NC_007641	GCC	2	6	1192	1197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83582732
24	NC_007641	TTA	2	6	1237	1242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007641	A	6	6	1246	1251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007641	A	6	6	1271	1276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007641	TTC	3	9	1315	1323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83582733
28	NC_007641	ATG	2	6	1333	1338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83582733
29	NC_007641	TTTC	2	8	1374	1381	0 %	75 %	0 %	25 %	83582733
30	NC_007641	T	6	6	1422	1427	0 %	100 %	0 %	0 %	83582733
31	NC_007641	GCAGG	2	10	1519	1528	20 %	0 %	60 %	20 %	83582733
32	NC_007641	TTGG	2	8	1544	1551	0 %	50 %	50 %	0 %	83582733
33	NC_007641	AGAA	2	8	1552	1559	75 %	0 %	25 %	0 %	83582733
34	NC_007641	CTT	2	6	1581	1586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83582733
35	NC_007641	TGG	2	6	1618	1623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83582733
36	NC_007641	CGA	2	6	1628	1633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83582733
37	NC_007641	GCAAC	2	10	1738	1747	40 %	0 %	20 %	40 %	83582733
38	NC_007641	CGT	2	6	1784	1789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83582733
39	NC_007641	ACC	2	6	1812	1817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83582733
40	NC_007641	TTGG	2	8	1858	1865	0 %	50 %	50 %	0 %	83582733
41	NC_007641	AGG	2	6	1934	1939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83582733
42	NC_007641	GGA	2	6	2012	2017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83582733
43	NC_007641	TTA	2	6	2031	2036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	83582733
44	NC_007641	CAT	2	6	2054	2059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83582733
45	NC_007641	AT	3	6	2114	2119	50 %	50 %	0 %	0 %	83582733
46	NC_007641	GGC	2	6	2120	2125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83582733
47	NC_007641	ACC	2	6	2205	2210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83582733
48	NC_007641	GAA	2	6	2211	2216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83582733
49	NC_007641	A	6	6	2240	2245	100 %	0 %	0 %	0 %	83582733
50	NC_007641	GA	3	6	2282	2287	50 %	0 %	50 %	0 %	83582733
51	NC_007641	GAA	2	6	2295	2300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83582733
52	NC_007641	A	7	7	2324	2330	100 %	0 %	0 %	0 %	83582733
53	NC_007641	TTC	2	6	2423	2428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83582734
54	NC_007641	TGGC	2	8	2528	2535	0 %	25 %	50 %	25 %	83582734
55	NC_007641	GATA	2	8	2561	2568	50 %	25 %	25 %	0 %	83582734
56	NC_007641	GAA	2	6	2591	2596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83582734
57	NC_007641	CCT	2	6	2660	2665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83582734
58	NC_007641	TCCAA	2	10	2704	2713	40 %	20 %	0 %	40 %	83582734
59	NC_007641	AGCG	2	8	2724	2731	25 %	0 %	50 %	25 %	83582734
60	NC_007641	TTC	2	6	2736	2741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83582734
61	NC_007641	CGT	2	6	2745	2750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83582734
62	NC_007641	AGA	2	6	2794	2799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83582734
63	NC_007641	AGG	2	6	2829	2834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83582734
64	NC_007641	CTC	3	9	2874	2882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83582734
65	NC_007641	ATG	2	6	2904	2909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83582734
66	NC_007641	CAA	2	6	3019	3024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_007641	AAG	2	6	3090	3095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83582735
68	NC_007641	TCT	2	6	3209	3214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83582735
69	NC_007641	GTC	2	6	3236	3241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83582735
70	NC_007641	TCG	2	6	3250	3255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83582735
71	NC_007641	CATC	2	8	3271	3278	25 %	25 %	0 %	50 %	83582735
72	NC_007641	CCT	2	6	3374	3379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83582735
73	NC_007641	AG	3	6	3409	3414	50 %	0 %	50 %	0 %	83582735
74	NC_007641	TCC	2	6	3455	3460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83582735
75	NC_007641	CG	3	6	3470	3475	0 %	0 %	50 %	50 %	83582735
76	NC_007641	ACG	2	6	3488	3493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83582735
77	NC_007641	CAT	2	6	3524	3529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83582735
78	NC_007641	CGG	2	6	3547	3552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83582735
79	NC_007641	CG	3	6	3578	3583	0 %	0 %	50 %	50 %	83582735
80	NC_007641	CGCT	2	8	3599	3606	0 %	25 %	25 %	50 %	83582735
81	NC_007641	GAC	2	6	3618	3623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83582735
82	NC_007641	T	6	6	3633	3638	0 %	100 %	0 %	0 %	83582735
83	NC_007641	CCGAA	2	10	3734	3743	40 %	0 %	20 %	40 %	83582735
84	NC_007641	CAA	2	6	3744	3749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	83582735
85	NC_007641	CCGCC	2	10	3755	3764	0 %	0 %	20 %	80 %	83582735
86	NC_007641	CGA	2	6	3767	3772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83582735
87	NC_007641	GC	3	6	3773	3778	0 %	0 %	50 %	50 %	83582735
88	NC_007641	ACG	2	6	3783	3788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83582735
89	NC_007641	T	6	6	3863	3868	0 %	100 %	0 %	0 %	83582735
90	NC_007641	AAG	2	6	3893	3898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83582735
91	NC_007641	TAA	2	6	3908	3913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	83582735
92	NC_007641	TCCC	2	8	3968	3975	0 %	25 %	0 %	75 %	83582735
93	NC_007641	GAAA	2	8	4066	4073	75 %	0 %	25 %	0 %	83582735
94	NC_007641	CGT	2	6	4092	4097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83582735
95	NC_007641	GCCT	2	8	4107	4114	0 %	25 %	25 %	50 %	83582735
96	NC_007641	AGA	2	6	4140	4145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83582735
97	NC_007641	TGA	2	6	4151	4156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83582735
98	NC_007641	ACG	2	6	4176	4181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83582735
99	NC_007641	TGAC	2	8	4237	4244	25 %	25 %	25 %	25 %	83582735
100	NC_007641	GGC	2	6	4256	4261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83582735
101	NC_007641	GTT	2	6	4283	4288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	83582735
102	NC_007641	AGC	2	6	4311	4316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83582735
103	NC_007641	TTC	2	6	4476	4481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83582735
104	NC_007641	ACGATA	2	12	4527	4538	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	83582735
105	NC_007641	GCTC	2	8	4575	4582	0 %	25 %	25 %	50 %	83582735
106	NC_007641	A	6	6	4588	4593	100 %	0 %	0 %	0 %	83582735
107	NC_007641	AG	3	6	4645	4650	50 %	0 %	50 %	0 %	83582735
108	NC_007641	ATATT	2	10	4684	4693	40 %	60 %	0 %	0 %	83582735
109	NC_007641	AGA	2	6	4699	4704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83582735
110	NC_007641	GAT	2	6	4705	4710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83582735
111	NC_007641	AT	3	6	4709	4714	50 %	50 %	0 %	0 %	83582735
112	NC_007641	AT	3	6	4721	4726	50 %	50 %	0 %	0 %	83582735
113	NC_007641	GCC	2	6	4760	4765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83582735
114	NC_007641	CAT	2	6	4793	4798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83582735
115	NC_007641	TCG	2	6	4949	4954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83582735
116	NC_007641	TTG	2	6	4966	4971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	83582735
117	NC_007641	TGC	2	6	5026	5031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83582735
118	NC_007641	ATG	2	6	5074	5079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83582735
119	NC_007641	GA	3	6	5102	5107	50 %	0 %	50 %	0 %	83582735
120	NC_007641	AAC	2	6	5160	5165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	83582735
121	NC_007641	ATT	2	6	5192	5197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007641	CAGA	2	8	5218	5225	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_007641	T	6	6	5286	5291	0 %	100 %	0 %	0 %	83582736
124	NC_007641	T	6	6	5293	5298	0 %	100 %	0 %	0 %	83582736
125	NC_007641	ATC	2	6	5304	5309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83582736
126	NC_007641	CAAG	2	8	5357	5364	50 %	0 %	25 %	25 %	83582736
127	NC_007641	ATG	2	6	5526	5531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83582736
128	NC_007641	GCCA	2	8	5637	5644	25 %	0 %	25 %	50 %	83582736
129	NC_007641	CGC	2	6	5667	5672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83582736
130	NC_007641	CTG	2	6	5676	5681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83582736
131	NC_007641	GCCCC	2	10	5699	5708	0 %	0 %	20 %	80 %	83582736
132	NC_007641	ATCC	2	8	5739	5746	25 %	25 %	0 %	50 %	83582736
133	NC_007641	GCC	2	6	5871	5876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83582736
134	NC_007641	CTT	2	6	5898	5903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83582736
135	NC_007641	ATC	2	6	5952	5957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83582736
136	NC_007641	ATC	2	6	5973	5978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83582736
137	NC_007641	GAC	2	6	6066	6071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83582736
138	NC_007641	AGG	2	6	6108	6113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83582736
139	NC_007641	GGC	2	6	6114	6119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83582736
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255	NC_007641	CGC	2	6	11856	11861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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259	NC_007641	AGGA	2	8	12040	12047	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
260	NC_007641	CTT	2	6	12063	12068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
261	NC_007641	TCC	2	6	12099	12104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
262	NC_007641	TTA	2	6	12105	12110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_007641	GCCC	2	8	12143	12150	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
264	NC_007641	TATT	2	8	12220	12227	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_007641	TTG	2	6	12279	12284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
266	NC_007641	TAC	2	6	12297	12302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
267	NC_007641	TG	3	6	12315	12320	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
268	NC_007641	A	6	6	12466	12471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_007641	GAG	2	6	12489	12494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83582740
270	NC_007641	CGC	2	6	12562	12567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83582740
271	NC_007641	CTT	2	6	12578	12583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83582740
272	NC_007641	GCC	2	6	12623	12628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83582740
273	NC_007641	GAA	3	9	12722	12730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83582740
274	NC_007641	CCGG	2	8	12731	12738	0 %	0 %	50 %	50 %	83582740
275	NC_007641	CTTG	2	8	12787	12794	0 %	50 %	25 %	25 %	83582740
276	NC_007641	GACC	2	8	12827	12834	25 %	0 %	25 %	50 %	83582740
277	NC_007641	GTC	2	6	12869	12874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83582740
278	NC_007641	CCGC	2	8	12916	12923	0 %	0 %	25 %	75 %	83582740
279	NC_007641	TTG	2	6	13040	13045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
280	NC_007641	GTCA	2	8	13048	13055	25 %	25 %	25 %	25 %	83582741
281	NC_007641	GGCA	2	8	13088	13095	25 %	0 %	50 %	25 %	83582741
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289	NC_007641	CTG	2	6	13373	13378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_007641	CGAGGT	2	12	13381	13392	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
291	NC_007641	GGT	2	6	13397	13402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
292	NC_007641	CGG	2	6	13451	13456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83582742
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401	NC_007641	GAT	2	6	18024	18029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83582748
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404	NC_007641	ATC	2	6	18223	18228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
405	NC_007641	CGGT	2	8	18317	18324	0 %	25 %	50 %	25 %	83582749
406	NC_007641	GTG	2	6	18331	18336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83582749
407	NC_007641	GGCGC	2	10	18348	18357	0 %	0 %	60 %	40 %	83582749
408	NC_007641	ACG	2	6	18358	18363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83582749
409	NC_007641	TCG	2	6	18383	18388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83582749
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465	NC_007641	ATC	2	6	20720	20725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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471	NC_007641	CA	3	6	20997	21002	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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